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Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

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Articles

Simultaneous determination by UPLC-MS/MS of seven bioactive compounds in rat plasma after oral administration of Ginkgo biloba tablets: application to a pharmacokinetic study

Wen-ping Wang, Na Liu, Qian Kang, Pei-pei Du, Yi Lan, Bo-chen Zhao, Yan-yan Chen, Qing Zhang, Hui Li, Ye-wen Zhang, Qing Wu

DOI: 10.1631/jzus.B1400035 Downloaded: 2973 Clicked: 5890 Cited: 2 Commented: 0(p.929-939) <Full Text><PPT> 1899

Chinese summary   <380>  UPLC-MS/MS法测定口服银杏叶片的大鼠血浆中七种活性成分及药代动力学研究

研究目的:建立一个快速灵敏且具有专属性的体内分析方法用于银杏叶片的药代动力学研究。
创新要点:运用超高压液相色谱-二级质谱连用法(UPLC-MS/MS)进行大鼠血浆中七种活性成分的测定,方法简单快速,适合于银杏叶制剂的药代动力研究。
研究方法:采用液液萃取进行血浆样品处理,该方法简单且快速。采用超高压液相色谱(UPLC)进行七种活性成分分离,达到了多种成分快速分离的目的。采用二级质谱(MS/MS)进行检测,优化质谱条件,减小了内源性干扰并提高检测灵敏度。经过专属性、线性、回收率、基质效应、精密度、准确度和稳定性考察,验证了该方法的适用性。经验证,该方法适用于银杏叶片的药代动力学研究。
重要结论:液液萃取处理血浆样品简单可靠,回收率稳定,无基质效应(表4)。UPLC-MS/MS能够快速、灵敏、专属性地分析大鼠血浆七种活性成分的血药浓度(表3和图3)。该方法适用于银杏叶片的七种活性成分的药代动力学研究(图4和5)。

关键词组:超高压液相色谱-二级质谱连用法(UPLC-MS/MS);银杏叶片;药代动力学

Essential oil from Zanthoxylum bungeanum Maxim. and its main components used as transdermal penetration enhancers: a comparative study

Yi Lan, Hui Li, Yan-yan Chen, Ye-wen Zhang, Na Liu, Qing Zhang, Qing Wu

DOI: 10.1631/jzus.B1400158 Downloaded: 2749 Clicked: 6344 Cited: 15 Commented: 0(p.940-952) <Full Text><PPT> 1908

Chinese summary   <375>  花椒挥发油与其主要成分经皮促透作用的比较研究

研究目的:比较花椒挥发油与其主要成分作为经皮促透剂的皮肤细胞毒性,对系列不同油水分配系数药物促透作用特征及其作用机制。
创新要点:选择系列不同油水分配系数中药活性成分简化并表征中药制剂中复杂有效成分,对比研究花椒挥发油与其主要成分的经皮促透作用特征差异。
研究方法:利用表皮角质形成细胞(HaCaT)和真皮成纤维细胞(CCC-ESF-1)测定其皮肤细胞毒性,选择系列不同油水分配系数中药活性成分作为模型药物测定花椒挥发油与其主要成分的经皮促透作用特征差异,并在此基础上采用傅利叶变换红外光谱(FTIR)等研究其促透作用机制。
重要结论:花椒挥发油相对于其单一组成成分具有更好的经皮促透效果。

关键词组:花椒挥发油;柠檬烯;促透剂;表皮角质形成细胞(HaCaT);傅利叶变换红外光谱(FTIR)

Temporal changes in soil bacterial and archaeal communities with different fertilizers in tea orchards

Hua Wang, Shao-hui Yang, Jing-ping Yang, Ya-min Lv, Xing Zhao, Ji-liang Pang

DOI: 10.1631/jzus.B1400114 Downloaded: 2614 Clicked: 6523 Cited: 3 Commented: 0(p.953-965) <Full Text><PPT> 1834

Chinese summary   <375>  不同肥料处理下茶园土壤细菌和古菌群落的时间变化研究

研究目的:研究化学肥料和有机肥处理条件下,茶园酸性土壤细菌和古菌群落结构,以及氮素转化相关功能酶基因丰度的时间变化规律。
创新要点:研究肥料、土壤温度及土壤含水量对茶园酸性土壤细菌和古菌群落结构,以及氮素转化相关功能酶基因丰度的影响。
研究方法:应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析茶园酸性土壤中细菌和古菌群落结构随时间的变化规律,应用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术,研究茶园酸性土壤细菌、古菌、硝化作用功能酶基因(细菌和古菌amoA基因)和细菌反硝化作用功能酶基因(narGnirKnirSnosZ基因)丰度的时间变化规律。
重要结论:茶园土壤细菌和古菌群落结构受到肥料的影响,并随着取样时间有显著的变化。细菌、古菌和古菌的amoA基因的丰度在7月份最小,而细菌的amoA基因和反硝化作用功能酶基因(除nirK基因)的丰度在9月份最小。有机肥处理增加了细菌、古菌和氮素转化相关功能酶基因的丰度,但化学肥料的施用对菌群及功能酶基因丰度的影响较小。土壤温度显著影响了土壤细菌和古菌的群落结构。土壤含水量与细菌反硝化作用功能酶基因有显著的相关性。土壤有机碳含量与细菌、古菌及功能酶基因丰度之间有显著的相关性。

关键词组:茶园;时间变化;肥料;细菌和古菌群落;氮素转化相关功能酶基因

Designing a SCAR molecular marker for monitoring Trichoderma cf. harzianum in experimental communities

Gabriel Prez, Valentina Verdejo, Clarissa Gondim-Porto, Julieta Orlando, Margarita Car

DOI: 10.1631/jzus.B1400063 Downloaded: 2622 Clicked: 6948 Cited: 2 Commented: 0(p.966-978) <Full Text><PPT> 1793

Chinese summary   <371>  SCAR分子标记监测菌群中的哈茨木霉

研究目的:开发具有种属特异性序列特征性扩增区域(SCAR)标记物来监测哈茨木霉在其入侵的试验菌群中的定殖和生长,为哈茨木霉应用于生物防治等生态和生物技术中提供支撑。
创新要点:多种木霉属真菌能与各种微观和宏观的生物有机体建立相互作用。利用这些相互作用,木霉可做为原生种群的入侵物种而用于生物防治。本文通过使用试验菌群为研究模型,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和序列特征性扩增区域(SCAR)标记物来监测菌群中哈茨木霉的生长状态。
研究方法:利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,从16个10聚体引物进行多态性筛选,其中1个引物扩增出对应哈茨木霉的条带。对该条带进行克隆测序,并设计5个20-23聚体引物。成功利用引物对2F2/2R2和2F2/2R3278分别特异性地扩增出哈茨木霉BpT10a菌株278 bp和448 bp的DNA片段。同时,用这两个引物对14个哈茨木霉菌株和几种不同的真菌菌株进行特异性对照试验,也只成功扩增出哈茨木霉菌株。此外,使用真菌DNA混合物和试验真菌群的DNA为模板,采用实时聚合酶链式反应(PCR)对引物对2F2/2R2进行评估。当仅使用100份SCAR标记物或哈茨木霉仅占整个菌群的0.1%时,仍能检测出哈茨木霉。
重要结论:本研究所建立的SCAR分子标记能有效监测菌群中的哈茨木霉的定殖和生长,具有较高特异性、灵敏度和准确度。

关键词组:哈茨木霉;序列特征性扩增区域(SCAR);分子标记;试验菌群

Vitreoscilla hemoglobin promotes Salecan production by Agrobacterium sp. ZX09

Yun-mei Chen, Hai-yang Xu, Yang Wang, Jian-fa Zhang, Shi-ming Wang

DOI: 10.1631/jzus.B1400123 Downloaded: 2607 Clicked: 4608 Cited: 1 Commented: 0(p.979-985) <Full Text><PPT> 1762

Chinese summary   <368>  在土壤杆菌ZX09中透明颤菌血红蛋白的表达提高索拉胶的产量

研究目的:提高胞外多糖索拉胶的产量。
创新要点:透明颤菌血红蛋白基因在质粒上表达,不加抗生素发酵生产索拉胶。
研究方法:将透明颤菌血红蛋白基因构建到广谱质粒pCM158上得到重组质粒pCM158-vgb,重组质粒转入土壤杆菌ZX09中,使透明颤菌血红蛋白在土壤杆菌ZX09中表达。
重要结论:在土壤杆菌ZX09中颤菌血红蛋白的表达解决了发酵过程中氧受限的问题,提高了宿主菌的呼吸速率、蔗糖酶活性和黏度,将发酵产物索拉胶的产量提高了30%。

关键词组:索拉胶;透明颤菌血红蛋白;土壤杆菌ZX09;蔗糖酶;呼吸速率

Positional variation in grain mineral nutrients within a rice panicle and its relation to phytic acid concentration

Da Su, Faisal Sultan, Ning-chun Zhao, Bing-ting Lei, Fu-biao Wang, Gang Pan, Fang-min Cheng

DOI: 10.1631/jzus.B1400157 Downloaded: 2392 Clicked: 5260 Cited: 1 Commented: 0(p.986-996) <Full Text><PPT> 1822

Chinese summary   <370>  水稻穗内不同粒位间的矿质营养变化差异及其与籽粒植酸含量的关系

研究目的:阐明水稻穗内不同粒位间的主要矿质营养元素和植酸含量差异、粒位分布特点及其与品种穗型间的联系。
创新要点:将水稻品种的穗型变化与稻米营养品质结合起来,从水稻穗粒结构角度,对同一稻穗内不同籽粒间的主要矿质营养元素与植酸含量差异、粒位分布特点及其与水稻品种穗型间的相互关系进行了较系统的探讨分析。
研究方法:以典型的直立穗型和弯穗型粳稻品种为材料,通过对两类水稻品种在相同栽培条件下籽粒矿质营养元素和植酸含量的测定分析,并依据水稻籽粒在稻穗上的着生部位,将同一稻穗内的不同籽粒划分为六个粒位,比较分析了两类品种同一稻穗内不同部位间矿质营养元素和植酸含量的差异变化及其粒位分布特点。
重要结论:水稻穗型虽然与品种间的籽粒矿质营养元素和植酸含量高低没有直接关系,但对其穗内不同籽粒间的主要矿质营养元素和植酸含量存在着较大影响;与稻穗中下部的弱势粒相比,同一稻穗内着生在稻穗上中部的强势粒通常具有相对较高的锌、铁矿质元素含量,而籽粒植酸含量和植酸/锌(铁)摩尔比则有所降低,稻米营养品质也相对较好;不同矿质营养元素相比,粒位效应对铁矿质营养的影响作用要略大于对钙和锌营养元素含量。

关键词组:水稻穗型;粒位效应;营养品质;矿质元素;植酸

Development of 107 SSR markers from whole genome shotgun sequences of Chinese bayberry (Myrica rubra) and their application in seedling identification

Hui-min Jia, Yu-tong Shen, Yun Jiao, Guo-yun Wang, Xiao Dong, Hui-juan Jia, Fang Du, Sen-miao Liang, Chao-chao Zhou, Wei-hua Mao, Zhong-shan Gao

DOI: 10.1631/jzus.B1400051 Downloaded: 5010 Clicked: 7797 Cited: 4 Commented: 0(p.997-1005) <Full Text><PPT> 2002

Chinese summary   <371>  基于杨梅基因组鸟枪法测序开发的107个SSR标记及其在品系鉴定中应用

研究目的:开发多态性高的基因组简单重复序列(SSR)标记,为杨梅遗传多样性、遗传图谱构建及品种鉴定相关研究奠定基础。
创新要点:从杨梅全基因组鸟枪法测序数据中新开发了107个SSR标记,并应用于品种间遗传多样性分析及品系鉴定。
研究方法:应用生物信息学软件从基因组测序数据中搜索SSR位点并设计相应引物,添加通用的M13尾巴和荧光标识筛选多态性高的SSR标记。
重要结论:开发的107个基因组SSR标记可以广泛应用于杨梅种质资源和遗传育种研究,鉴定出三个杨梅新品系。

关键词组:杨梅;简单序列重复(SSR)标记;遗传多样性

A mutation of Aspergillus niger for hyper-production of citric acid from corn meal hydrolysate in a bioreactor

Wei Hu, Jing Liu, Ji-hong Chen, Shu-yang Wang, Dong Lu, Qing-hua Wu, Wen-jian Li

DOI: 10.1631/jzus.B1400132 Downloaded: 2710 Clicked: 5018 Cited: 9 Commented: 0(p.1006-1010) <Full Text><PPT> 2160

Chinese summary   <376>  高产柠檬酸突变菌株以玉米粉为原料的生物反应器扩大生产研究

研究目的:研究高产黑曲霉突变菌株以玉米粉为原料的生物反应器扩大发酵,以期获得适合于工业化生产柠檬酸的发酵工艺。
创新要点:以玉米粉为原料,系统地研究了筛选得到的高产菌株在50 L生物反应器中不同糖浓度发酵生产柠檬酸的特性,最终优化出适合于工业化生产柠檬酸的发酵工艺。
研究方法:(1)利用淀粉酶对粉碎后的玉米进行液化,然后过滤,最终得上清液;(2)以50 L生物反应器作为发酵设备,对筛选得到的高产柠檬酸菌株进行扩大培养;(3)通过测定不同培养时期中积累的柠檬酸含量和剩余的残总糖,最终优化出高效率生产柠檬酸的发酵工艺。
重要结论:以不同糖浓度的液化玉米粉上清液作为碳源,突变菌株H4002能积累177.7~196.0 g/L的柠檬酸,效率能达到2.96~3.27 g/(L∙h),尤其当糖浓度为210 g/L,H4002菌株表现出最佳的柠檬酸生产水平,如柠檬酸积累187.5 g/L,生产效率达3.13 g/(L∙h)。上述结果说明了突变菌株H4002拥有快速生产柠檬酸的能力。

关键词组:突变;柠檬酸生产;玉米粉液化液;黑曲霉

Erratum

Erratum to: Identification of a novel mutation in a Chinese family with Nance-Horan syndrome by whole exome sequencing

Nan Hong, Yan-hua Chen, Chen Xie, Bai-sheng Xu, Hui Huang, Xin Li, Yue-qing Yang, Ying-ping Huang, Jian-lian Deng, Ming Qi, Yang-shun Gu

DOI: 10.1631/jzus.B13e0321 Downloaded: 2175 Clicked: 5280 Cited: 0 Commented: 0(p.1011-1011) <Full Text>

Retraction Note

Retraction Note to: Characterization of cancer stem-like cells in the side population cells of human gastric cancer cell line MKN-45

Hai-hong Zhang, Ai-zhen Cai, Xue-ming Wei, Li Ding, Feng-zhi Li, Ai-ming Zheng, Da-jiang Dai, Rong-rong Huang, Hou-jun Cao, Hai-yang Zhou, Jian-mei Wang, Xue-jing Wang, Wei Shi, Heng Zhu, Xiao-ying Yuan, Lin Chen

DOI: 10.1631/jzus.B12r0102 Downloaded: 2160 Clicked: 5145 Cited: 0 Commented: 0(p.1012-1012) <Full Text>

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