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Journal of Zhejiang University SCIENCE B
ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly
2017 Vol.18 No.10 P.833-920
Articles
Transcriptome sequencing and annotation of the halophytic microalga Dunaliella salina
Ling Hong, Jun-li Liu, Samira Z. Midoun, Philip C. Miller
DOI: 10.1631/jzus.B1700088 Downloaded: 2039 Clicked: 3382 Cited: 0 Commented: 0(p.833-844) <Full Text><PPT> 1396
创新点：本研究通过高通量测序产生了大量来自杜氏盐藻整个生长周期的转录组数据，描述了杜氏盐藻在盐胁迫下累积的渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素的代谢过程。另外通过该手段也进一步分析了盐胁迫处理下，抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响。
方法：以来自3个不同生长时期的杜氏盐藻为材料，进行大规模转录组测序。在转录组功能注释的基础上，预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物（图3）、多胺（图4）和类胡萝卜素（图5）的代谢路径。利用相对定量聚合酶链反应（qPCR）技术构建了相关代谢路径中关键基因的表达谱（图6）。
结论：通过杜氏盐藻转录组测序共获取了39 820条单一序列。在功能注释和聚类分析的基础上预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物（甘油和脯氨酸）、多胺以及类胡萝卜素的代谢路径。相关代谢途径的关键酶的表达谱分析，说明盐能够调节甘油、脯氨酸以及多胺的代谢过程。抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响。
关键词组：杜氏盐藻；转录谱；代谢过程与调控；调节机制；盐胁迫
Nominal effective immunoreaction volume of magnetic beads at single bead level
Rui Wang, Yuan Chen, Kai Fan, Feng Ji, Jian Wu, Yong-hua Yu
DOI: 10.1631/jzus.B1600358 Downloaded: 2316 Clicked: 5173 Cited: 0 Commented: 0(p.845-853) <Full Text><PPT> 1560
创新点：首次提出"单个磁珠的有效免疫反应体积"这一概念，提出在微观水平上对磁珠免疫反应进行探究，为进一步研究磁珠-抗原免疫反应的动力学过程打下基础。
方法：首先，采用两种直径的磁珠对50 µl不同浓度的抗原进行比色检测，证明磁珠上抗原的结合位点过量。随后，采用定量磁珠对相同浓度不同体积的抗原进行检测，得出"单个磁珠的有效免疫反应体积"这一概念。接着，采用三种不同用量的磁珠对浓度相同、体积梯度增大的抗原进行检测，以验证所提出的NEIV的概念。然后，通过测定孵育时长、孵育温度和震荡与否对比色结果的影响，找到对NEIV影响的关键因素。最后采用定量磁珠，对梯度稀释的抗原进行检测，建立磁珠用量与比色结果的关系，对NEIV的实际应用提出展望。
结论：对于同一直径的磁珠，在相同的孵育条件下，其单个磁珠的NEIV是恒定的，与磁珠用量和孵育体积无关。孵育温度、孵育时长和震荡与否是影响NEIV值的关键因素。采用NEIV这一参数可以在大体积样本检测之前，对磁珠的用量模拟提供有效指导。除此之外，NEIV更从微观角度上揭示了磁珠和抗原的免疫反应过程，为进一步研究磁珠-抗原免疫反应的动力学过程奠定了基础。
关键词组：单个磁珠有效免疫反应体积（NEIV）；免疫磁珠；酶联免疫吸附测定（ELISA）；磁珠直径；孵育方式
Phenolic compounds participating in mulberry juice sediment formation during storage
Bo Zou, Yu-juan Xu, Ji-jun Wu, Yuan-shan Yu, Geng-sheng Xiao
DOI: 10.1631/jzus.B1600461 Downloaded: 2364 Clicked: 4960 Cited: 0 Commented: 0(p.854-866) <Full Text><PPT> 1491
创新点：首次研究了桑果汁贮藏期间上清和沉淀中酚类物质的变化规律，阐明了酚类物质参与桑果汁沉淀形成的机制，明确了花色苷是沉淀形成的主要物质基础。
方法：对贮藏期间桑果汁的上清和沉淀进行了分离，提取了游离态和结合态多酚，对总酚含量的变化进行了研究，并采用高效液相色谱法和高效液相色谱质谱联用法对酚类化合物的组成进行了定性和定量分析。
结论：随着贮藏时间的延长，桑果汁的沉淀量逐渐增加（图1），果汁上清液和沉淀游离酚的总酚含量逐渐下降，而沉淀结合酚则呈现上升趋势（图2）。上清液和沉淀中游离态花色苷分别从938.60和235.60 mg/L下降到2.30和1.74 mg/L（表2），上清中黄酮类物质也有所下降，而沉淀中结合态的没食子酸、原儿茶酸、咖啡酸和芦丁的含量则呈上升趋势（表2）。桑果汁贮藏8周后，沉淀中的花色苷占酚类物质总量的67.2%（表2）。综上所述，酚类物质参与了桑果汁沉淀的形成，其中花色苷起主要作用。
关键词组：桑果汁；酚类物质；沉淀；花色苷；抗氧化
Zhan-mei Jiang, Li-na Bai, Nan Yang, Zhi-biao Feng, Bo Tian
DOI: 10.1631/jzus.B1700082 Downloaded: 1865 Clicked: 4634 Cited: 0 Commented: 0(p.867-877) <Full Text><PPT> 1371
创新点：首次证实乳清蛋白与半乳糖美拉德反应产物（WPI-半乳糖MRPs）有助于提高β-胡萝卜素微胶囊的贮存稳定性。
方法：利用扫描电镜观察β-胡萝卜素微胶囊形态特征；用激光粒度分析微胶囊颗粒的大小；以微胶囊的保留率为检测指标，研究温度、pH、空气、白炽光照及其紫外光照对微胶囊贮存稳定性的影响。
结论：以WPI-半乳糖MRPs为壁材的β-胡萝卜素微胶囊表面光滑完整，没有裂缝和孔隙，有少量典型的凹陷；以WPI-半乳糖MRPs为壁材的微胶囊粒径比以WPI-半乳糖混合物为壁材的微胶囊粒径小；从温度、pH、空气、白炽光照及紫外光照五个方面进行研究发现，以WPI-半乳糖MRPs为壁材的β-胡萝卜素微胶囊贮存稳定性显著优于以WPI半乳糖的混合物为壁材的β-胡萝卜素微胶囊贮存稳定性；WPI-半乳糖MRPs有助于提高β-胡萝卜素微胶囊的稳定性。
关键词组：美拉德反应产物（MRPs）；乳清蛋白；β-胡萝卜素；微胶囊；稳定性
Ming-mei Liu, Bin Qi, Zheng-xu Liu, Jin-shun Zhan, Kang Zhan, Guo-qi Zhao
DOI: 10.1631/jzus.B1600293 Downloaded: 2260 Clicked: 5276 Cited: 0 Commented: 0(p.878-885) <Full Text><PPT> 1467
创新点：结合提取时间和异丙醇浓度，将超声波（超声时间、功率）用于辅助异丙醇去除大豆高丰度蛋白和富集低丰度蛋白的研究。
方法：在单因素试验基础上，设计了超声时间、超声功率、提取时间和异丙醇浓度等四因素三水平的正交试验。并通过测定提取液中的蛋白浓度和通过聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）、质谱分析（MS）等蛋白质组学手段鉴定提取液或丙酮沉淀物中的蛋白质含量，实现了大豆高丰度蛋白去除和低丰度蛋白提取条件的优化。
结论：50%异丙醇，350 W超声15 min，提取1 h是大豆低丰度蛋白提取的最佳条件。提取物含多种低丰度蛋白（油质蛋白、大豆未知蛋白、磷酸酯D和无特征大豆蛋白），且无大豆高丰度蛋白（大豆球蛋白和β-伴大豆球蛋白）。
关键词组：蛋白提取；高丰度蛋白；低丰度蛋白；低温脱脂豆粕；质谱
Xin-zheng Nie, Sha Chen, Xiao-xu Zhang, Bin-yang Dai, Li-chun Qian
DOI: 10.1631/jzus.B1600280 Downloaded: 2490 Clicked: 5085 Cited: 0 Commented: 0(p.886-896) <Full Text><PPT> 1539
创新点：试验采用的中性植酸酶能够耐受饲料加工温度，并从营养物质消化及磷利用等方面研究中性植酸酶对鲫鱼的影响，探究低磷日粮在水产养殖的应用。
方法：384条鲫鱼（(1.50±0.01) g）随机分为6组，分别饲喂对照组（未添加中性植酸酶）跟试验组（添加不同剂量中性植酸酶）日粮63天，比较3组间各项指标差异。
结论：在以植物蛋白为主的日粮中，添加中性植酸酶能够促进植酸磷水解，提高鲫鱼对饲粮中磷、粗蛋白等营养物质的利用，促进钙、磷等矿物质在鲫鱼体中的沉积，降低粪磷排出量，促进鲫鱼生长。说明可以在鲫鱼日粮中添加中性植酸酶，减少无机磷的添加，降低粪磷排放，从而减轻环境污染。
关键词组：中性植酸酶；鲫鱼；生长性能；磷利用；表观消化率；鱼体成分
Shi-kai Fan, Jun Zhu, Wen-hao Tian, Mei-yan Guan, Xian-zhi Fang, Chong-wei Jin
DOI: 10.1631/jzus.B1600272 Downloaded: 2210 Clicked: 4292 Cited: 2 Commented: 0(p.897-905) <Full Text><PPT> 1440
创新点：首次提出尿素、铵态氮和硝态氮肥料的分次施用方式可提升镉污染土壤上的作物安全生产。
方法：选用尿素、硫酸铵和硝酸钙等3种常用氮肥，通过盆栽试验，比较了这3种肥料的分次施用方法和一次性施用方法对小白菜的镉含量、生物量以及营养品质的影响。
结论：在镉污染的条件下，与一次性施肥相比，尿素和硫酸铵的分次施肥方法显著降低了小白菜可食部位的镉含量，增加了可食部位的生物量并改善了抗氧化相关的营养品质指标；然而，当硝酸钙作为氮肥时，小白菜可食部位的镉含量、生物量以及抗氧化相关的营养品质指标在两种不同的施肥方法之间并无统计学上的显著差异。因此，在镉污染的土壤上，当硫酸铵或尿素作为氮肥时，分次施肥方法比一次性施肥方法更加有利于保障蔬菜的安全生产与品质改善。
关键词组：施肥方法；镉污染；氮肥；营养品质
Wen-jie Lu, Hao-lei Cai, Ma-dong Ye, Yu-lian Wu, Bin Xu
DOI: 10.1631/jzus.B1600597 Downloaded: 2035 Clicked: 3756 Cited: 0 Commented: 0(p.906-916) <Full Text><PPT> 1414
创新点：以目前为止最大样本量的近端胰腺非侵袭性肿瘤的剜除手术的数据分析，证实了剜除手术在这类患者中的安全性和有效性，即使肿瘤直径>3 cm或临近主胰管肿瘤。并且首次报道和证实了在这些患者剜除手术中发生主胰管损伤，进行主胰管修补与支架置入是安全有效的。分析了同期进行不同手术方式患者的肿瘤资料，阐明了肿瘤大小影响手术策略的制定。
方法：详细对比了剜除手术和传统的胰十二脂肠切除术以及胰腺中段切除术的术前情况、术中情况、术后并发症资料（表1~3），尤其详细描述了临近主胰管和主胰管有损伤的患者剜除手术后并发症情况（表4）。同时，附图说明了主胰管修补手术方法（图1）。
结论：近端胰腺非侵袭性肿瘤的剜除手术是安全有效的，应该是这类患者手术治疗的首选推荐方式，在大肿瘤和临近主胰管的肿瘤患者中也可施行。
关键词组：剜除；胰瘘；胰十二脂肠切除术；胰腺中段切除
Correspondence
Shu-ming Liu, Shi-jun Wang, Si-yao Song, Yong Zou, Jun-ru Wang, Bing-yin Sun
DOI: 10.1631/jzus.B1700232 Downloaded: 1780 Clicked: 3387 Cited: 0 Commented: 0(p.917-920) <Full Text><PPT> 1357
关键词组：花椒栽培种；挥发油；组成；特征性差异；气相色谱法-质谱法联用法（GC-MS）；聚类分析