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Polishing & Checking

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2018 Vol.19 No.1 P.1-84

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Editorial

A warning for Chinese academic evaluation systems: short-term bibliometric measures misjudge the value of pioneering contributions

Xiao-jun Hu, Jian-hong Luo, Ronald Rousseau

DOI: 10.1631/jzus.B1700569 Downloaded: 1628 Clicked: 3213 Cited: 0 Commented: 0(p.1-5) <Full Text><PPT> 1360

Chinese summary   <19>  对中国学术评价体系的警示--短期文献计量指标误判科学先驱性工作价值

概要:虽然用短期文献计量指标评估科学家成就的现行做法在学术界受到许多争议和质疑,但是这一"根深蒂固"的观念和评估方法在现实中一直难以改变,主要原因是长期以来在政策制定者、科学家和使用者之间存在着很大裂缝.为纠正这种有明显缺陷的"文献计量"评估方法,我们对一些诺贝尔奖获得者的主要论文,进行了基于大数据的引用特征系列研究.通过对观察节点在科学引文索引数据库(Web of Science)引用网络中百万篇论文节点间的深度关系分析,我们发现:许多真正的奠基性工作,并没有像耀眼的火焰在科学星空中闪烁出灿烂光芒;相反,它们更像是导火索上的星星火花,点燃大量后续研究火焰继而引发了科学界的转型.结合资深专家访谈,我们呼吁科学同盟者们应该意识到,"误用短期文献计量指标"等同于"道义上犯罪",评价体系应该更强调"创新源头",助推潜在的颠覆性与转型性研究.

关键词组：学术评价;科学先驱性工作;诺贝尔奖;文献计量指标;短期评估

Review

Review: Towards precision medicine: from quantitative imaging to radiomics

U. Rajendra Acharya, Yuki Hagiwara, Vidya K. Sudarshan, Wai Yee Chan, Kwan Hoong Ng

DOI: 10.1631/jzus.B1700260 Downloaded: 3281 Clicked: 5101 Cited: 0 Commented: 0(p.6-24) <Full Text><PPT> 1622

Chinese summary   <18>  精准医学发展趋势:从定量成像到放射组学

概要:放射学(影像学)及影像引导的介入手段能提供多参数的形态学及功能信息,在精准医学中扮演着越来越重要的角色.因此,放射科医生需要理解影像表型,并将这些表型与潜在的疾病相关联,进而描述图像特征.但是为了能理解并描述异质性实体肿瘤的分子表型(基因组学信息),就需要通过活检取得这些组织更进一步的序列信息.因此,放射科医生为了能获得详尽的影像表型,需要从不同视图和角度采集图像,而这就产生了大量的数据.从所有这些影像数据中提取有意义的细节非常具有挑战性,并衍生出了大数据这个命题.因为影像组学有对诊断支持提供有意义的诠释性和预测性信息的潜力,所以近年来对于影像组学的关注越来越多.影像组学是传统的计算机辅助诊断、深度学习和人类技能的结合,因此它能被用来定量描述肿瘤表型.本文对影像组学流程的概览、基于不同手段(如计算机断层扫描(CT)、磁共振成像(MRI)和正电子发射计算机断层扫描(PET))的影像组学研究结果、面临的挑战和影像组学对于精准医学潜在的贡献等方面进行了讨论.
(感谢浙江大学医学院附属第二医院核医学科陈琳提供中文概要)

关键词组：放射影像学;个体化医学;精准医学;定量成像;放射基因组学;放射组学

Articles

Gene locations may contribute to predicting gene regulatory relationships

Jun Meng, Wen-Yuan Xu, Xiao Chen, Tao Lin, Xiao-Yu Deng

DOI: 10.1631/jzus.B1700303 Downloaded: 1862 Clicked: 3449 Cited: 0 Commented: 0(p.25-37) <Full Text><PPT> 1455

Chinese summary   <19>  基因位置可以用于预测基因调控关系

目的:证明基因位置顺序与基因调控顺序的关系,说明利用基因位置顺序信息可以作为预测基因调控关系的先验知识.
创新点:通过研究与斑马鱼心脏发育阶段有关的基因和miRNA,利用时空邻域法,建立了一个基于时间的基因调控网络.通过这个基因调控网络,我们获得了一些特殊的基因调控通路和基因之间调控的时间顺序.通过研究斑马鱼心脏发育阶段有关的基因在染色体上的位置,将基因位置顺序与基因调控时间顺序比较,我们发现了这两个顺序具有逆转现象.这个逆转现象的存在,可以帮助我们利用基因位置顺序来预测基因调控关系和调控的时间顺序.
方法:采用时空邻域法研究了斑马鱼心脏发育阶段的基因和miRNA,建立基因调控网络(图5),并通过进一步比较,得到了基因位置顺序和基因调控时间顺序的联系.
结论:基因位置顺序信息可以用于预测基因调控关系.

关键词组：预测;基因调控关系;基因位置顺序信息;时空邻域法;斑马鱼心脏发育期

A finite element analysis of the stress distribution to the mandible from impact forces with various orientations of third molars

Yun-Feng Liu, Russell Wang, Dale A. Baur, Xian-Feng Jiang

DOI: 10.1631/jzus.B1600552 Downloaded: 2789 Clicked: 5283 Cited: 0 Commented: 0(p.38-48) <Full Text><PPT> 1749

Chinese summary   <17>  有限元方法分析具有不同形态第三磨牙的下颌骨受到冲击力时的应力分布

目的:评估下颌骨在具有不同形态的第三磨牙或者没有第三磨牙的情况下,当遭受到前部或侧部2000 N冲击力时,其应力分布.
创新点:第三磨牙的存在对下颌骨的力学性能有影响,而且不同位置形态的第三磨牙对下颌骨的力学性能的影响存在差异.
方法:根据一个具有完整牙列的健康下颌骨的计算机断层扫描(CT)图像构建出其三维模型,以CT图像上的Hounsfield值(HU)为基础,计算出下颌骨的力学性能参数(包括密度和杨氏模量),共分成9组数据.构建出第三磨牙分别为水平向、垂直向以及近中方向呈45度角时的完全阻生和部分阻生的共6组下颌骨计算模型.并以无第三磨牙的下颌骨为基准模型,利用有限元方法计算在下颌前部和侧面分别受到2000 N的静态冲击力的情况下Von Mises应力分布.
结论:有限元分析结果显示,相同载荷条件下,当第三磨牙部分阻生时的下颌骨髁突颈和角部区域的应力值比完全阻生时要大,因此具有部分阻生第三磨牙的下颌骨具有更高的骨折风险;当具有水平向部分阻生的第三磨牙时,下颌骨骨折的风险最大.对于各种计算模型,下颌骨受到侧向冲击力时,应力最大位置均位于下颌角区;对于无第三磨牙的下颌骨,应力最大位置位于髁突颈部区域,此时髁突颈更容易发生骨折.

关键词组：有限元分析;第三磨牙;下颌骨;生物力学仿真

Electrocardiogram (ECG) patterns of left anterior fascicular block and conduction impairment in ventricular myocardium: a whole-heart model-based simulation study

Yuan Gao, Ling Xia, Ying-Lan Gong, Ding-Chang Zheng

DOI: 10.1631/jzus.B1700029 Downloaded: 2359 Clicked: 5918 Cited: 0 Commented: 0(p.49-56) <Full Text><PPT> 1611

Chinese summary   <18>  左前分支传导阻滞与心室肌传导障碍心电图研究:基于全心脏模型仿真

目的:探究左前分支传导阻滞与心室肌传导速度减慢的体表心电图之间相似之处,并探究其机理.
创新点:通过心电图仿真,证明了左心室前壁传导速度减慢会形成类似左前分支阻滞的波形,并结合仿真心脏电兴奋传导时序,对其机理进行了合理解释.
方法:将真实人体心脏通过64位螺旋计算机断层扫描(CT),进行心脏解剖结构建模.通过单域模型仿真出全心脏电兴奋的传导时序,然后利用边界元法计算出各时刻人体体表电位,进而计算出十二导联心电图.
结论:左心室前壁心肌细胞传导速度的减慢,会形成类似左前分支阻滞的心电图波形,其主要区别是QRS波群的时间跨度以及幅度大小.

关键词组：心电图;仿真;心脏建模;左前分支阻滞

Effect of corticosteroids on atrial fibrillation after catheter ablation: a meta-analysis#

Sanjay Jaiswal, Xian-bao Liu, Qu-cheng Wei, Ying-hao Sun, Li-han Wang, Liu-guang Song, Dan-dan Yang, Jian-an Wang

DOI: 10.1631/jzus.B1600529 Downloaded: 2261 Clicked: 4479 Cited: 0 Commented: 0(p.57-64) <Full Text><PPT> 1655

Chinese summary   <19>  皮质类固醇对导管消融术后心房颤动影响的荟萃分析

目的:探讨皮质类固醇对导管消融术后心房颤动(AF)的影响.
创新点:首个探讨皮质类固醇对导管消融术后AF影响的荟萃分析.
方法:我们在PubMed、Embase和Cochrane对照试验中心注册库中搜索了描述皮质类固醇对预防导管消融后AF复发影响的文章,并提取了研究和患者的相关数据.使用随机效应模型计算风险比(RR)和95%置信区间(CI),P<0.05被认为具有统计学差异.
结论:导管消融术围术期皮质类固醇的使用与AF早期复发减少相关,但与晚期复发无关.

关键词组：心房颤动;皮质类固醇;导管消融术;荟萃分析

Activity of metalloproteinases and adiponectin in obese patients—a possible factor of incisional hernias after bariatric procedures

Wojciech Szcz?sny, Magdalena Kuligowska-Prusi?ska, Stanis?aw D?browiecki, Jakub Szmytkowski, Adrian Re?li?ski, Maciej S?upski

DOI: 10.1631/jzus.B1600383 Downloaded: 2113 Clicked: 4137 Cited: 0 Commented: 0(p.65-70) <Full Text><PPT> 1418

Chinese summary   <19>  肥胖患者体内金属蛋白酶和脂联素的活性-- 肥胖手术后造成切口疝的可能因素

目的:主要研究病态肥胖患者与正常人血清中金属蛋白酶2(MMP-2)、MMP-9、MMP-13和脂联素的浓度.
创新点:建立血清中MMP-2、MMP-9、MMP-13和脂联素的浓度与肥胖和切口疝的关系.
方法:参与实验的人员为进行肥胖手术的患者和不进行肥胖手术的患者,并将他们分为两组:I(体重指数(BMI)≥35 kg/m2,n=40)和II(BMI<25 kg/m2,n=30),并使用酶联免疫吸附实验测定受试人员体内血清中MMP-2、MMP-9、MMP-13和脂联素的浓度.
结论:MMP-2的浓度在肥胖组中更高,且在两组血清中有显著性差异.虽然MMP-9的浓度在肥胖组中更高,但是两组之间没有显著性差异.MMP-13在两组间没有差异.血清中脂联素的浓度在非肥胖组更高,但无显著性差异.因此,血清中MMP-2和MMP-9的浓度在肥胖人群中与更高的切口疝发病率有关.

关键词组：金属蛋白酶;脂联素;肥胖症;切口疝

Complementary feeding patterns among ethnic groups in rural western China

Peng-fei Qu, Ya Zhang, Jia-mei Li, Ruo Zhang, Jiao-mei Yang, Fang-liang Lei, Shan-shan Li, Dan-meng Liu, Shao-nong Dang, Hong Yan

DOI: 10.1631/jzus.B1600504 Downloaded: 2233 Clicked: 4829 Cited: 0 Commented: 0(p.71-78) <Full Text><PPT> 1614

Chinese summary   <20>  中国西部农村地区婴幼儿辅食喂养状况民族差异的调查

目的:比较中国西部农村地区四个民族(汉、维、藏和壮)的婴幼儿的辅食喂养状况,探讨影响婴幼儿辅食喂养的影响因素.
创新点:在中国西部10省区开展大规模人群流行病学调查,对比分析西部农村地区四个主要民族(汉、维、藏和壮)的婴幼儿的辅食添加的时间、类别、频率及质量,探讨其差异的可能原因,以及研究影响西部农村地区辅食喂养的可控因素,为西部农村地区不同民族改善婴幼儿辅食喂养状况提供干预措施.
方法:采用人口比例抽样法,在2005年调查西部10省区45县9172个6~35个月的婴幼儿的辅食添加状况(7411汉、1032维、678藏和591壮),构建了适合西部地区的婴幼儿喂养指数(ICFI),综合评价婴幼儿辅食喂养质量.
结论:汉族和壮族婴幼儿的喂养质量好于维族和藏族.母亲教育水平、家庭经济水平和喂养宣传是影响婴幼儿辅食喂养质量的重要因素,合理的干预措施是促进西部地区婴幼儿辅食添加质量的关键.

关键词组：辅食喂养;婴幼儿喂养指数;多民族;中国西部地区

Correspondence

Physical interactions and mutational analysis of MoYpt7 in Magnaporthe oryzae

Lu-Yao Huang, Min Wu, Xiao-Yun Yu, Lin Li, Fu-Cheng Lin, Xiao-Hong Liu

DOI: 10.1631/jzus.B1700336 Downloaded: 2047 Clicked: 4440 Cited: 0 Commented: 0(p.79-84) <Full Text><PPT> 1438

Chinese summary   <18>  稻瘟病菌MoYpt7互作蛋白和点突变的研究

目的:研究MoYpt7与MoGdi1的互作关系以及定点突变体MoYpt7N125I的生物学功能.
创新点:补充了MoYpt7在稻瘟病菌致病过程中的生物学功能.
方法:采用双分子荧光互补和免疫共沉淀的方法检测MoYpt7与MoGdi1的相互作用.利用点突变的方法,分析MoYpt7的鸟嘌呤二核苷酸磷酸(GDP)结合形式的生物学功能.
结论:MoYpt7与Rab-GDP解离抑制因子的一个同源物MoGdi1相互作用,获得了MoYpt7的GDP结合形式的过表达突变体.该突变体菌落形态发生变化,产孢能力和致病性显著下降.同时,稻瘟病菌MoYpt7N125I的亚细胞定位发生变化.

关键词组：双分子荧光互补;免疫沉淀;MoGdi1;MoYpt7

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