Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005, Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018), 2.082 (2019), 3.066 (2020), 5.552 (2021).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2024 Vol.25 No.4 P.271-360

Cover:

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Contents:

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CONTENTS

Reviews

Review: Impacts of pancreatic exocrine insufficiency on gut microbiota

Yulin GUO, Feng CAO, Fei LI

DOI: 10.1631/jzus.B2300070 Downloaded: 295 Clicked: 400 Cited: 0 Commented: 0(p.271-279) <Full Text> <PPT > 29

Chinese summary <9> 胰腺外分泌功能不全对肠道微生物群的影响

郭玉霖^1,2，曹锋^1,2，李非^1,2
¹首都医科大学宣武医院普通外科，中国北京市，100053
²首都医科大学急性胰腺炎临床诊疗中心，中国北京市，100053
摘要：胰腺外分泌功能不全（PEI）可由多种疾病引起，包括慢性胰腺炎、急性胰腺炎、胰腺切除术后等。PEI其主要发病机制与胰蛋白酶合成下降、胰液流动紊乱、分泌反馈失衡有关。动物研究表明：PEI可诱导肠道细菌过度生长和生态失调，其中乳杆菌和双歧杆菌的丰度增加最为多见；肠道细菌过度生长和生态失调可通过胰酶替代治疗得到部分逆转。临床研究也证实PEI与肠道菌群失调之间存在关联。胰脏外分泌水平的下降，伴随PEI产生的十二指肠pH值的改变，以及PEI引起的胆盐吸收不良，这可能是PEI导致肠道菌群丰度和组成发生改变的潜在作用机制。反之，肠道微生物群也可能通过潜在的双向调节影响胰腺外分泌腺泡的功能。展望未来，仍需要更多的高质量研究来揭示胰腺外分泌不足对肠道微生物群影响的机制。

关键词组：胰腺外分泌不足；肠道微生物群；肠道微生物组；胰酶替代疗法

Review: Emerging role of lncRNAs as mechanical signaling molecules in mechanotransduction and their association with Hippo-YAP signaling: a review

Siyi LIN, Xinyu HE, Ying WANG, Yu CHEN, Aifu LIN

DOI: 10.1631/jzus.B2300497 Downloaded: 209 Clicked: 227 Cited: 0 Commented: 0(p.280-292) <Full Text> <PPT > 32

Chinese summary <4> LncRNAs在机械转导中的作用及其与Hippo-YAP信号转导的关联

林思怡¹，何欣豫^2,3,4，王颖^2,3,4，陈妤^2,3,4，林爱福^2,3,4,5,6,7
¹浙江大学医学院，中国杭州市，310058
²浙江大学生命科学学院，中国杭州市，310058
³浙江大学癌症研究院，中国杭州市，310058
⁴浙江省细胞与基因工程重点实验室，中国杭州市，310058
⁵浙江大学医学院附属第四医院国际医学院，中国义乌市，322000
⁶恶性肿瘤预警与干预教育部重点实验室，中国杭州市，310058
⁷浙江大学长三角智慧绿洲创新中心，中国嘉兴市，314100
摘要：细胞在组织中受到各种机械力的作用，包括静水压力、剪切应力、压缩和张力。这些机械刺激可通过机械感受器或细胞骨架依赖性反应过程转化为生化信号，从而塑造微环境，并维持细胞生理平衡。研究已证实转录共激活因子YAP/TAZ可作为机械转导因子，对细胞表型（如分化和疾病发病）产生动态影响。这种调节功能涉及细胞骨架、核骨架、整合素、局灶黏附蛋白（FA），以及多种信号通路的整合，包括细胞外信号调节蛋白激酶（ERK）、WNT和Hippo信号通路。此外，最新研究表明长链非编码RNA（lncRNA）可作为机械敏感分子在机械转导过程中发挥作用。本综述讨论了YAP/TAZ和lncRNA响应机械刺激的机制，并总结了参与机械转导的关键信号分子。

关键词组：YAP/TAZ；长链非编码RNA（lncRNA）；机械转导；F-肌动蛋白

Research Articles

Unlocking the growth potential: harnessing the power of synbiotics to enhance cultivation of Pleurotus spp.

Reshma PATIL, Aizi Nor Mazila RAMLI, Ang Shu XUAN, Ng Zhi XIN, Nur Izyan Wan AZELEE, Prakash BHUYAR

DOI: 10.1631/jzus.B2300383 Downloaded: 222 Clicked: 330 Cited: 0 Commented: 0(p.293-306) <Full Text> <PPT > 34

Chinese summary <5> 释放生长潜力：利用合生元的力量加强侧耳属植物种植

Reshma PATIL^1,2，Aizi Nor Mazila RAMLI^1,2，Ang Shu XUAN¹，Ng Zhi XIN¹，Nur Izyan Wan AZELEE³，Prakash BHUYAR^4,5
¹马来西亚彭亨苏丹阿卜杜拉大学工业科学与技术学院（UMPSA），马来西亚甘孟市，26300
²Bio芳香卓越研究中心，马来西亚彭亨苏丹阿卜杜拉大学，马来西亚甘孟市，26300
³马来西亚工艺大学工程学院生物工艺与聚合物工程系，马来西亚新山市，81310
⁴梅州大学国际学院有机农业管理（MJU-IC），泰国清迈市，50290
⁵梅州大学国际学院国际工农业创新研究中心（IIAR），泰国清迈市，50290
摘要：平菇（Pleurotus spp.）是全球最广泛栽培的蘑菇品种之一。本研究旨在探讨合生元对Pleurotus ostreatus和Pleurotus pulmonarius生长和品质的影响。通过每日对蘑菇样品喷洒不同浓度的合生元，测量其生长参数、产量、生物效率、近似成分、矿物质含量、总酚含量和二苯基-1-三硝基苯肼（DPPH）自由基清除活性。结果表明，使用喷洒菊粉和干酪乳杆菌的合生元，平菇的产量最高（56.92克），生物效率也最高（12.65%）。菊粉和干酪乳杆菌的组合最为高效，可以同时提高两种样品蘑菇的生长性能和营养成分。此外在白平菇（P. ostreatus）中，菊粉和干酪乳杆菌组合的合生元可产生最高的总酚含量（20.550 mg GAE/g DE），而在灰蘑菇（P. pulmonarius）中产生最高总酚含量的是干酪乳杆菌（1.098 mg GAE/g DE），其次是菊粉和干酪乳杆菌（1.079 mg GAE/g DE）。DPPH结果表明，平菇可以作为一种有效的抗氧化剂。综上，合生元可通过增加酚类化合物的含量来提高蘑菇的抗氧化能力，并通过增加矿物质元素的含量来提供更好的健康益处，从而提高了蘑菇的品质。上述研究证明了合生元作为一种生物肥料用于蘑菇栽培的应用潜力，是帮助蘑菇种植者解决质量不稳定的一个有效方案。

关键词组：抗氧化剂；生物肥料；成长表现；蘑菇种植；侧耳属；合生元

Nrf2-mediated ferroptosis of spermatogenic cells involved in male reproductive toxicity induced by polystyrene nanoplastics in mice

Xufeng FU, Hang HAN, Hong YANG, Bo XU, Wenjie DAI, Ling LIU, Tiantian HE, Xing DU, Xiuying PEI

DOI: 10.1631/jzus.B2300138 Downloaded: 292 Clicked: 492 Cited: 0 Commented: 0(p.307-323) <Full Text> <PPT > 31

Chinese summary <6> Nrf2介导的生精细胞铁死亡参与了聚苯乙烯纳米塑料导致的小鼠雄性生殖毒性

付旭锋^1,2，韩杭¹，杨宏¹，许博¹，代文杰¹，刘玲¹，何甜甜¹，杜星¹，裴秀英^1,2
¹宁夏医科大学生育力保持教育部重点实验室，中国银川市，750004
²宁夏生殖与遗传学重点实验室，中国银川市，750004
摘要：由于大量塑料废弃物的排放和一次性口罩的广泛使用，所产生的微塑料（MPs）和纳米塑料（NPs）已被认为是有害物质，但它们对健康的具体影响仍不确定。本研究将荧光标记的聚苯乙烯纳米塑料（PS-NPs）注射到小鼠体内以确定NPs在体内的分布和潜在的毒性作用，通过动物活体成像发现PS-NPs在小鼠睾丸中有明显积累。因此，本文研究了PS-NPs对雄性小鼠生殖系统和对生精细胞的毒性作用及机制。通过雄性小鼠灌胃暴露50 nm和90 nm的PS-NPs后，其生精能力受到影响且生精细胞受损；在体外暴露发现，PS-NPs会影响精母细胞系GC-2的存活；利用RNA-seq进一步分析其毒理机制，发现PS-NPs通过铁死亡途径影响GC-2细胞；通过线粒体形态、Fe²⁺水平、脂质过氧化、线粒体膜电位和不稳定铁等方面评价了PS-NPs引起GC-2细胞铁死亡的表型，进一步明确铁死亡抑制剂Fer-1可以逆转铁死亡表型。随后，发现Nrf2在PS-NPs诱导GC-2细胞铁死亡中起重要作用，并且抑制Nrf2后可加剧PS-NPs诱导的GC-2细胞铁死亡。最后，通过体内实验进一步证实了Nrf2在PS-NPs诱导的雄性生殖毒性中发挥保护作用。因此，本研究表明，PS-NPs通过引起Nrf2介导的生精细胞铁死亡进而导致小鼠雄性生殖功能障碍。

关键词组：聚苯乙烯纳米塑料（PS-NPs）；雄性生殖毒性；铁死亡；核因子e2相关因子2（Nrf2）

Large-scale genome-wide SNP analysis reveals the rugged (and ragged) landscape of global ancestry, phylogeny, and demographic history in chicken breeds

Natalia V. DEMENTIEVA, Yuri S. SHCHERBAKOV, Olga I. STANISHEVSKAYA, Anatoly B. VAKHRAMEEV, Tatiana A. LARKINA, Artem P. DYSIN, Olga A. NIKOLAEVA, Anna E. RYABOVA, Anastasiia I. AZOVTSEVA, Olga V. MITROFANOVA, Grigoriy K. PEGLIVANYAN, Natalia R. REINBACH, Darren K. GRIFFIN, Michael N. ROMANOV

DOI: 10.1631/jzus.B2300443 Downloaded: 246 Clicked: 339 Cited: 0 Commented: 0(p.324-340) <Full Text> <PPT > 34

Chinese summary <5> 大规模全基因组SNP分析揭示了鸡品种的全球祖先、种群发展和种群历史的复杂(和多样)的遗传图谱

Natalia V. DEMENTIEVA¹, Yuri S. SHCHERBAKOV¹, Olga I. STANISHEVSKAYA¹, Anatoly B. VAKHRAMEEV¹,Tatiana A. LARKINA¹, Artem P. DYSIN¹, Olga A. NIKOLAEVA¹, Anna E. RYABOVA¹, Anastasiia I. AZOVTSEVA¹,Olga V. MITROFANOVA¹, Grigoriy K. PEGLIVANYAN¹, Natalia R. REINBACH¹, Darren K. GRIFFIN²,Michael N. ROMANOV^2,3
¹Russian Research Institute of Farm Animal Genetics and Breeding - Branch of the L. K. Ernst Federal Research Centre for Animal Husbandry, Pushkin, St. Petersburg, 196601, Russia
²School of Biosciences, University of Kent, Canterbury, CT2 7NJ, UK
³L. K. Ernst Federal Research Center for Animal Husbandry, Dubrovitsy, Podolsk, Moscow Oblast, 142132, Russia
摘要：全球范围内的鸡品种基因库中涵盖了数量庞大且多样化起源的多种品系，不过这个数量正逐渐减少。本研究采用了大规模的全基因组分析，探究了49个种群的复杂分子结构、遗传变异性以及详细结构组成。这些种群来自于欧洲（如俄罗斯、捷克共和国、法国、西班牙、英国等）、亚洲（如中国）、北美（如美国）和大洋洲（如澳大利亚），代表了世界各地的鸡品种。我们使用Illumina 60K单核苷酸多态性（SNP）芯片对品种进行了基因型分析，然后进行了生物信息学分析。这一分析包括了杂合子/纯合子统计、近交系数和有效种群大小的计算，以及连锁不平衡的评估和系统发生树的构建。通过多维缩放、主成分分析和ADMIXTURE辅助全球祖先分析，我们探索了每个品种种群和亚群的遗传结构。此外，还进行了总体的49个种群的系统发生分析，并提出了一种精细化的鸡品种形成演化模型，其中包括蛋、肉、兼用型和混合的品种。利用现代基因组方法对家禽养殖中的遗传资源进行如此大规模的调查，不仅对于普遍了解家鸡遗传学的角度具有重要意义，而且对于进一步发展家禽育种中的基因组技术和方法也是至关重要的。总而言之，对来自全球基因库的有发展潜力的鸡品种进行全基因组SNP基因分型，将促进现代基因组学在家禽育种中的进一步发展。

关键词组：鸡基因组多样性；单核苷酸多态性分析（SNP)；基因库；全球原始祖先；种群发展史；种群大小历史

ELABELA-derived peptide ELA13 attenuates kidney fibrosis by inhibiting the Smad and ERK signaling pathways

Zhibin YAN, Ying SHI, Runling YANG, Jijun XUE, Caiyun FU

DOI: 10.1631/jzus.B2300033 Downloaded: 71 Clicked: 135 Cited: 0 Commented: 0(p.341-353) <Full Text> <PPT > 35

Chinese summary <7> ELABELA衍生肽ELA13通过抑制Smad和ERK信号通路减轻肾纤维化

闫志斌¹，史影²，杨润玲³，薛吉军²，付彩云^1,3
¹浙江理工大学生命科学与医药学院，浙江省家蚕生物反应器和生物医药重点实验室，中国杭州市，310018
²兰州大学化学化工学院，功能有机分子化学国家重点实验室，中国兰州市，730000
³兰州大学甘肃省新药临床前研究重点实验室，中国医学科学院多肽研究创新单元（2019RU066），中国兰州市，730000
摘要：肾脏纤维化是各种慢性肾脏疾病发展为终末期肾病的关键过程。目前尚无针对肾纤维化的特异性治疗方法。ELA13（氨基酸序列：RRCMPLHSRVPFP）是ELABELA在所有脊椎动物中的保守片段，目前对其生物学活性的研究却很少。本研究评估了ELA13对转化生长因子β1（TGF-β1）处理的NRK-52E细胞和单侧输尿管闭塞（UUO）小鼠的作用效果。首先，体外实验表明在TGF-β1诱导的NRK-52E细胞中，ELA13可以降低纤维化标志物I型胶原（Collagen I）、纤连蛋白（fibronectin）和α-平滑肌肌动蛋白（α-SMA）的表达水平。随后，在UUO诱导的小鼠肾纤维化模型中，我们发现ELA13可以通过降低血清中肌酐和尿素氮的含量来改善肾功能，并通过Masson染色、免疫组织化学、实时定量聚合酶链式反应（RT-PCR）和蛋白质印迹（western blot）的结果证实纤维化标志物和炎症标志物的表达降低了。进一步机制研究发现，ELA13处理可抑制Smad和细胞外调节蛋白激酶（ERK）信号通路。综上所述，ELA13通过抑制Smad和ERK信号通路发挥抗肾纤维化的作用，有望成为抗肾纤维化治疗的候选分子。

关键词组：ELA13；肾纤维化；炎症反应；Smad；细胞外调节蛋白激酶（ERK）

Correspondence

Correspondence: Seizure as the main presenting manifestation of three patients with acute glufosinate-ammonium poisoning

Ping WANG, Congying SONG, Xuan LU, Yuanqiang LU

DOI: 10.1631/jzus.B2300469 Downloaded: 202 Clicked: 299 Cited: 0 Commented: 0(p.354-358) <Full Text> <PPT > 27

Chinese summary <4> 三例以癫痫为主要表现的急性草铵膦中毒患者的病例报告

王萍^1,2，宋聪颖^1,2，陆璇^2,3，陆远强^1,2
¹浙江大学医学院附属第一医院急诊科，中国杭州市，310003
²浙江省增龄与理化损伤性疾病诊治研究重点实验室，中国杭州市，310003
³浙江大学医学院附属第一医院老年科，中国杭州市，310003
摘要：草铵膦作为谷氨酸（Glu）的结构类似物，可以不可逆地抑制植物中谷氨酰胺合成酶（GS）和谷氨酸脱羧酶活性，从而阻止谷氨酰胺（Gln）生成，最终导致植物因氮代谢紊乱和细胞内氨积累而死亡。人误服草胺磷后也会出现相应的中毒症状，包括胃肠道症状和神经毒性。草铵膦作为最常见的致癫痫类除草剂，且无特定解毒剂，因此支持性治疗至关重要。在临床诊治过程中，如何及时有效识别草铵膦除草剂引起的神经毒性并提供适当治疗尤为关键。本文介绍了我院三名草铵膦中毒患者的主要症状，其中癫痫是主要的神经表现。随后，通过查阅相关文献，对草铵膦引发神经毒性的相关机制进行了总结，并讨论了神经毒性的预测和检测方法。

关键词组：草铵膦；癫痫；除草剂中毒；头部CT

Errata

Erratum: Erratum to: Bioinformatic analysis for potential biological processes and key targets of heart failure-related stroke

Chiyu LIU, Sixu CHEN, Haifeng ZHANG, Yangxin CHEN, Qingyuan GAO, Zhiteng CHEN, Zhaoyu LIU, Jingfeng WANG

DOI: 10.1631/jzus.B20e0544 Downloaded: 28 Clicked: 63 Cited: 0 Commented: 0(p.359-359) <Full Text>

Erratum: Erratum to: Molecular dynamics simulation reveals DNA-specific recognition mechanism via c-Myb in pseudo-palindromic consensus of mim-1 promoter

Jinru WENG, Shuo YANG, Jinkang SHEN, Hongsen LIU, Yuzi XU, Dongyun HAO, Shan WANG

DOI: 10.1631/jzus.B22e0634 Downloaded: 30 Clicked: 49 Cited: 0 Commented: 0(p.360-360) <Full Text>