Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2023 Vol.24 No.8 P.663-754

Cover:

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Contents:

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<<< CONTENTS >>>

Review

Review: MRI-derived radiomics models for diagnosis, aggressiveness, and prognosis evaluation in prostate cancer

Xuehua ZHU, Lizhi SHAO, Zhenyu LIU, Zenan LIU, Jide HE, Jiangang LIU, Hao PING, Jian LU

DOI: 10.1631/jzus.B2200619 Downloaded: 920 Clicked: 1240 Cited: 0 Commented: 0(p.663-681) <Full Text> <PPT> 472

Chinese summary <32> MRI相关影像组学模型用于前列腺癌诊断、侵袭性和预后评估

朱学华¹，邵立智²，刘振宇^2,3，刘泽南¹，何继德¹，刘建刚^4,5，平浩⁶，卢剑¹
¹北京大学第三医院泌尿外科，中国北京市，100191
²中国科学院自动化研究所分子影像重点实验室，中国北京市，100190
³中国科学院大学人工智能学院，中国北京市，100080
⁴北京航空航天大学医工交叉创新研究院大数据精准医疗高精尖创新中心，中国北京市，100191
⁵工业和信息化部大数据精准医疗重点实验室（北京航空航天大学），中国北京市，100191
⁶首都医科大学附属北京同仁医院泌尿外科，中国北京市，100730
摘要：前列腺癌（PCa）是一种具有高度异质性的恶性肿瘤，这给PCa的精准诊断和最佳个性化治疗带来了难题。具备解剖和功能序列的多参数磁共振成像（mp-MRI）已经发展成为PCa检测和分期的重要工具。此外，随着人工智能（AI）和图像数据处理技术的快速发展，利用影像组学的方法定量提取医学影像数据迎来广阔的应用前景。影像组学通过提取影像特征来获得影像标志物，并在此基础上建立预测模型进行精确评估。影像组学模型提供了一个辅助精准医疗的可靠且无创的替代方案，较基于临床病理指标的传统模型具有明显优势。本综述致力于对PCa影像组学相关研究进行归纳总结，重点探讨了基于MRI的影像组学模型的开发和验证。本综述对有关PCa诊断、侵袭性和预后评估方面的影像组学预测模型相关文献进行了回顾和总结，重点关注具有临床应用潜力的预测模型。此外，我们深入探讨了不同模型可以解决的关键问题，以及在具体临床背景下可能遇到的困难。因此，本综述有助于鼓励研究人员根据实际的临床需求构建预测模型，并帮助泌尿外科医生更好地了解影像组学相关的重要研究成果。

关键词组：核磁共振；影像组学；前列腺癌；预测模型

Research Articles

Cytokine receptor-like factor 1 (CRLF1) promotes cardiac fibrosis via ERK1/2 signaling pathway

Shenjian LUO, Zhi YANG, Ruxin CHEN, Danming YOU, Fei TENG, Youwen YUAN, Wenhui LIU, Jin LI, Huijie ZHANG

DOI: 10.1631/jzus.B2200506 Downloaded: 949 Clicked: 1224 Cited: 0 Commented: 0(p.682-697) <Full Text> <PPT> 404

Chinese summary <27> 细胞因子受体样因子1（CRLF1）通过ERK1/2信号通路促进心脏纤维化

罗神坚¹，杨芷²，陈如鑫³，游丹铭²，滕菲¹，袁幼文¹，刘雯辉²，李晋⁴，张惠杰^1,2,3
¹南方医科大学南方医院，内分泌代谢科，中国广州市，510515
²南方医科大学，广东省医学休克微循环重点实验室，中国广州市，510515
³南方医科大学南方医院，器官衰竭防治国家重点实验室，中国广州市，510515
⁴山西医科大学第二医院，内分泌科，中国太原市，030001
摘要：心脏纤维化是心脏疾病患者发病和死亡的原因之一。抗纤维化治疗是一种治疗心脏疾病的重要手段，但目前对纤维化的机制仍缺乏深入了解。本研究旨在确定细胞因子受体样因子1（CRLF1）在心脏纤维化中的功能并阐明其调节机制。我们发现CRLF1主要在心脏成纤维细胞中表达；无论是在心肌梗死诱导的小鼠心脏纤维化模型还是在转化生长因子-β1（TGF-?β1）刺激的小鼠和人心脏成纤维细胞中，CRLF1表达均上调。本研究在使用或不使用TGF-β1刺激的新生乳鼠心脏成纤维细胞（NMCFs）中开展了CRLF1的功能获得和丧失实验。在TGF-β1刺激或不刺激的情况下，CRLF1的过表达均可增加NMCFs的细胞活力、胶原生成、细胞增殖能力及肌成纤维细胞转化，而CRLF1沉默则具有相反效果。应用细胞外信号调节激酶1/2（ERK1/2）信号通路抑制剂以及包括SMAD依赖和非依赖信号在内的不同TGF-β1下游信号通路抑制剂来开展机制研究。CRLF1通过激活ERK1/2信号通路发挥其功能。此外，CRLF1在TGF-β1处理的NMCFs中表达上调是由SMAD依赖性通路介导，而不是SMAD非依赖性通路介导。总而言之，心脏纤维化中TGF-β1/SMAD信号通路的激活增加了CRLF1的表达。随后，CRLF1通过激活ERK1/2信号通路加重了心脏纤维化。因此，CRLF1可作为一个干预和治疗心脏纤维化的新的潜在靶点。

关键词组：细胞因子受体样因子1（CRLF1）；转化生长因子-β1（TGF-β1）/SMAD信号通路；细胞外信号调节激酶1/2（ERK1/2）信号通路；心脏纤维化；肌成纤维细胞转化；细胞外基质（ECM）

FOXO1-miR-506 axis promotes chemosensitivity to temozolomide and suppresses invasiveness in glioblastoma through a feedback loop of FOXO1/miR-506/ETS1/FOXO1

Chao CHEN, Yu'e LIU, Hongxiang WANG, Xu ZHANG, Yufeng SHI, Juxiang CHEN

DOI: 10.1631/jzus.B2200503 Downloaded: 1036 Clicked: 1037 Cited: 0 Commented: 0(p.698-710) <Full Text> <PPT> 392

Chinese summary <21> FOXO1/miR-506/ETS1/FOXO1环路抑制胶质母细胞瘤侵袭性并促进替莫唑胺化疗敏感性

陈超¹，刘玉娥²，王洪祥¹，张旭¹，施裕丰²，陈菊祥¹
¹海军军医大学第一附属医院神经外科，中国上海市，200433
²同济大学医学院第十人民医院肿瘤中心，中国上海市，200092
摘要：为了探索FOXO1在胶质母细胞瘤（GBM）进展和化疗耐药中的作用和机制，本研究采用体外细胞学实验和动物实验分析FOXO1和miR-506对GBM细胞系U251增殖、凋亡、迁移、侵袭、自噬和替莫唑胺（TMZ）化疗敏感性的影响，并通过双荧光素酶报告实验分析FOXO1与miR-506相互作用的靶点。结果显示：FOXO1-miR-506轴可抑制GBM细胞侵袭和迁移能力，并促进其对TMZ的化疗敏感性，且自噬参与其中；FOXO1作为转录因子可与miR-506启动子区域相结合并上调其表达；此外，miR-506可结合在E26转录因子-1（ETS-1）3’-UTR区并下调ETS1表达，而ETS1可促进FOXO1从细胞核向细胞浆转移进而抑制FOXO1-miR-506轴。裸鼠动物实验结果显示，过表达FOXO1可促进GBM对TMZ的化疗敏感性，但miR-506抑制剂和过表达ETS1均可逆转该现象。综上所述，FOXO1/miR-506/ETS1/FOXO1环路参与GBM侵袭性和化疗敏感性的调节，可作为GBM治疗的潜在靶点。

关键词组：胶质母细胞瘤；FOXO1；MiR-506；E26转录因子-1（ETS-1）；化疗敏感性

Composite B-cell and T-cell lymphomas: clinical, pathological, and molecular features of three cases and literature review

Xueli JIN, Hui LIU, Jing LI, Xibin XIAO, Xianggui YUAN, Panpan CHEN, Boxiao CHEN, Yun LIANG, Fengbo HUANG

DOI: 10.1631/jzus.B2300181 Downloaded: 831 Clicked: 1209 Cited: 0 Commented: 0(p.711-722) <Full Text> <PPT> 483

Chinese summary <19> 三例复合性B细胞和T细胞淋巴瘤患者的临床、病理和分子学特征的分析及文献回顾

金雪立¹，刘辉²，李晶³，肖希斌¹，袁相贵¹，陈攀攀¹，陈博晓⁴，梁赟¹，黄封博²
¹浙江大学医学院附属第二医院血液科，中国杭州市，310009
²浙江大学医学院附属第二医院病理科，中国杭州市，310009
³浙江大学医学院附属第二医院核医学科，中国杭州市，310009
⁴浙江大学医学院，中国杭州市，310029
摘要：复合性B细胞和T细胞淋巴瘤发病率很低。为了研究复合性淋巴瘤的临床、病理和分子学特征，本文报道了三例复合性B细胞和T细胞淋巴瘤患者，并通过免疫组化、流式细胞术和二代测序检测分析患者的病理和分子学特征。第一例患者通过皮肤活检、骨髓活检和流式细胞术明确诊断为皮肤T细胞淋巴瘤和骨髓弥漫大B细胞淋巴瘤。另外两例患者通过淋巴结粗针穿刺活检和骨髓活检明确诊断为B细胞淋巴瘤，但疾病复发后再次经过病理活检明确诊断为T细胞淋巴瘤，同时二代测序检测发现了DNA甲基转移酶3a（DNMT3a）和肿瘤蛋白p53（TP53）等基因突变。在此基础上，本文回顾了复合性淋巴瘤的相关文献，并总结了复合性B细胞和T细胞淋巴瘤的临床、病理和分子特征。我们发现复合性淋巴瘤的发病和EB病毒感染，以及DNMT3a、异柠檬酸脱氢酶2（IDH2）和TP53突变等相关，同时该疾病的预后与侵袭性更高的T细胞淋巴瘤成分密切相关。

关键词组：复合性淋巴瘤；B细胞淋巴瘤；T细胞淋巴瘤

Suppression of NLRP3 inflammasome by ivermectin ameliorates bleomycin-induced pulmonary fibrosis

Mai A. ABD-ELMAWLA, Heba R. GHAIAD, Enas S. GAD, Kawkab A. AHMED, Maha ABDELMONEM

DOI: 10.1631/jzus.B2200385 Downloaded: 1262 Clicked: 2585 Cited: 0 Commented: 0(p.723-733) <Full Text> <PPT> 466

Chinese summary <22> 伊维菌素抑制NLRP3炎症小体可改善博来霉素诱导的肺纤维化

Mai A. ABD-ELMAWLA¹，Heba R. GHAIAD¹，Enas S. GAD^2,3，Kawkab A. AHMED⁴，Maha ABDELMONEM¹
¹埃及开罗大学药学院生物化学系，埃及开罗，11562
²费萨尔国王大学药学院药学系，沙特阿拉伯哈萨，31982
³埃及西奈大学药学院药理毒理学系，埃及伊斯梅利亚，45511
⁴埃及开罗大学兽医学院病理学系，埃及开罗，12211
摘要：伊维菌素是美国食品药品监督管理局（FDA）批准的抗寄生虫剂，具有抗病毒和抗炎特性。尽管最近有研究表明伊维菌素在呼吸系统损伤中可能具有抗炎活性，但其对肺纤维化（PF）的潜在影响尚未得到验证。本研究旨在探讨伊维菌素（0.6 mg/kg）在PF大鼠模型中减轻博来霉素诱导的生化紊乱和组织学变化的效果。这可用于验证伊维菌素作为治疗特发性PF在临床上的效用。在本研究中，伊维菌素减轻了博来霉素诱发的肺损伤，表现为炎症细胞浸润减少以及炎症和纤维化评分降低。值得注意的是，伊维菌素减少了胶原纤维的沉积并抑制了转化生长因子-β1（TGF-β1）和纤连蛋白的表达，突显了其抗纤维化活性。本研究首次揭示伊维菌素可以抑制NOD样受体家族含吡啶结构域蛋白3（NLRP3）炎症小体，表现为NLRP3和含有半胱天冬酶募集结构域的凋亡相关斑点样蛋白（ASC）基因的表达减少，以及白细胞介素-1β（IL-1β）水平的下降。此外，伊维菌素抑制细胞内核因子-κB（NF-κB）和缺氧诱导因子-1α（HIF-1α）蛋白的表达，同时降低氧化应激和凋亡标志物的水平。本研究表明，伊维菌素可以改善博来霉素引起的肺部炎症和纤维化，并且部分功能是通过下调TGF-β1和纤连蛋白以及通过调节HIF-1α和NF-κB的表达抑制NLRP3炎性小体来介导的。

关键词组：气管内滴注；免疫组化；转化生长因子-β1（TGF-β1）；核转录因子-κB（NF-κB）；肺纤维化

Lactobacillus gasseri LA39 promotes hepatic primary bile acid biosynthesis and intestinal secondary bile acid biotransformation

Jun HU, Qiliang HOU, Wenyong ZHENG, Tao YANG, Xianghua YAN

DOI: 10.1631/jzus.B2200439 Downloaded: 743 Clicked: 1092 Cited: 0 Commented: 0(p.734-748) <Full Text> <PPT> 498

Chinese summary <21> 格氏乳酸杆菌LA39促进了肝脏初级胆汁酸的生物合成和肠道次级胆汁酸的生物转化

胡军^1,2,3，侯奇良^1,2,3，郑文涌^1,2,3，杨涛^1,2,3，晏向华^1,2,3
¹农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室，湖北洪山实验室，动物育种与健康养殖前沿科学中心，动物科学技术学院，华中农业大学，中国武汉市， 430070
²生猪健康养殖协同创新中心，中国武汉市， 430070
³生猪精准饲养与饲料安全技术湖北省工程实验室，中国武汉市， 430070
摘要: 越来越多的证据已将肠道微生物与肝脏代谢联系在一起。肠道菌群干预已被视为一条有望促进肝脏健康的途径。然而，格氏乳酸杆菌LA39（一种潜在的益生菌）对肝脏代谢的影响仍不明确。大量的研究已通过分析蛋白组图谱来挖掘受微生物影响的宿主生物学事件，并利用无菌小鼠模型来研究宿主与微生物的互作。在本研究中，我们探讨了格氏乳酸杆菌LA39灌服处理对无菌小鼠肝脏蛋白表达图谱的影响。结果表明，格氏乳酸杆菌LA39可导致128个肝脏蛋白质的表达上调，以及123个肝脏蛋白质的表达下调。进一步的生物信息学分析表明，格氏乳酸杆菌LA39可激活肝脏中初级胆汁酸的生物合成通路。蛋白免疫印迹实验进一步验证了参与初级胆汁酸生物合成通路的三个差异表达蛋白（CYP27A1、CYP7B1和CYP8B1）。此外，靶向代谢组学分析证明了格氏乳酸杆菌LA39可显著增加血清和粪便中的β-鼠胆酸（一种初级胆汁酸）、脱氢石胆酸（一种次级胆汁酸）和甘氨石胆酸-3-硫酸盐（一种次级胆汁酸）的含量。综上所述，格氏乳酸杆菌LA39可激活肝脏中初级胆汁酸的生物合成，并促进肠道中次级胆汁酸的生物转化。这些研究发现暗示了格氏乳酸杆菌LA39通过调控胆汁酸代谢在肠-肝轴中发挥了重要功能。

关键词组：格氏乳酸杆菌LA39；肝脏；同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）；胆汁酸；无菌小鼠

Correspondence

Correspondence: Rapid visual detection of Vibrio parahaemolyticus by combining LAMP-CRISPR/Cas12b with heat-labile uracil-DNA glycosylase to eliminate carry-over contamination

Fang WU, Chen LU, Wenhao HU, Xin GUO, Jiayue CHEN, Zhidan LUO

DOI: 10.1631/jzus.B2200705 Downloaded: 768 Clicked: 945 Cited: 0 Commented: 0(p.749-754) <Full Text> <PPT> 448

Chinese summary <15> 结合LAMP-CRISPR/Cas12b与热敏感尿嘧啶DNA糖苷酶实现可消除残留污染的副溶血弧菌快速可视化检测

吴芳^1,2，卢辰^1,2，胡文灏^1,2，郭馨³，陈佳玥^1,2，罗志丹^1,2
¹江苏海洋大学，江苏省海洋生物资源与环境重点实验室，江苏省海洋药物活性分子筛选重点实验室，中国连云港市， 222005
²江苏海洋大学，江苏省海洋生物产业技术协同创新中心，中国连云港市， 222005
³江苏百时美生物科技有限公司，中国连云港市， 222005
摘要: 作为海产品中的主要致病菌，副溶血弧菌的快速准确检测对于海水健康养殖和避免副溶血弧菌相关食源性疾病的发生至关重要。本研究结合尿嘧啶DNA糖苷酶（UDG)、环介导等温扩增（LAMP)和CRISPR/Cas12b技术，建立了海产品中副溶血弧菌的一锅法检测技术。该检测系统实现了一管化检测，并可避免残留污染的风险。我们通过优化dNTP混合物中dTTP/dUTP比例，并筛选出最优sgRNA。该方法在最优条件下，对副溶血弧菌纯培养物的检出限低至1×10² CFU/mL，在虾肉样品的检出限低至1×10² CFU/g。该方法对其他微生物病原体无交叉反应，且与荧光定量PCR结果符合率为100%。

关键词组：尿嘧啶糖苷酶；环介导等温扩增；CRISPR/Cas12b；副溶血弧菌；一锅法检测