Current Issue: <JZUS-B>

 

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.


JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).


Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

   Cover:  <192>
      
Contents:  <235>

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Review

Review: Exosome-mediated regulatory mechanisms in skeletal muscle: a narrative review

Zhaolu WANG, Jinjin YANG, Xiaohui SUN, Xi SUN, Gongshe YANG, Xin'e SHI

DOI: 10.1631/jzus.B2200243 Downloaded: 951 Clicked: 1110 Cited: 0 Commented: 0(p.1-14) <Full Text>   <PPT>  282

Chinese summary   <91>  骨骼肌中外泌体介导的调节机制:叙述性综述

王召路,杨金金,孙晓晖,孙喜,杨公社,史新娥
西北农林科技大学动物科学与技术学院,陕西杨陵,712100
概要:骨骼肌在机体活动、新陈代谢和能量平衡中发挥着至关重要的作用,而其稳态受到多种因素的挑战,例如受伤、衰老和肥胖。外泌体是细胞外囊泡的一个子集,是细胞间通讯的重要介质,在治疗骨骼肌疾病方面具有巨大临床潜力。我们通过概述外泌体提取、鉴定和功能机制的研究进展,并重点讨论来自多个器官、组织的外泌体和工程化外泌体在调节骨骼肌生理与病理发育方面的最新成果,以扩大我们对肌肉发生与肌肉疾病的理解范围。同时,工程化外泌体作为内源性纳米载体,与先进的生物分子设计方法结合后,将有助于为肌肉疾病的治疗开辟新前景。

关键词组:外泌体;骨骼肌;肌肉萎缩;胰岛素抵抗

Research Articles

Spatial transcriptome analysis of long non-coding RNAs reveals tissue specificity and functional roles in cancer

Kang XU, Xiyun JIN, Ya LUO, Haozhe ZOU, Dezhong LV, Liping WANG, Limei FU, Yangyang CAI, Tingting SHAO, Yongsheng LI, Juan XU

DOI: 10.1631/jzus.B2200206 Downloaded: 844 Clicked: 1024 Cited: 0 Commented: 142(p.15-31) <Full Text>   <PPT>  268

Chinese summary   <90>  长链非编码RNA空间转录组分析揭示组织特异性和癌症中的功能

徐康1,靳喜云1,罗芽1,邹昊哲1,吕德重1,王丽萍1,付丽妹1,蔡阳阳1,邵婷婷1,李永生2,徐娟1
1哈尔滨医科大学生物信息学科学与技术学院,中国哈尔滨市,150081
2海南医学院热带转化医学教育部重点实验室,生物医学信息与工程学院,海南省妇女儿童医学中心,中国海口市,571199
目的:长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)在维持组织形态和功能方面发挥着重要作用,其精确调控效应与其表达模式密切相关。然而,lncRNA在人体内的空间表达模式还未得到明确刻画。
方法:在本研究中,我们构建了5个完整的人类lncRNAs转录组图谱,覆盖了数千个正常或疾病状态下的主要组织样本。在不同资源的相同组织中,lncRNA转录组表现出高度的一致性,在特定组织中则表现出更高的复杂性。在每个资源中都发现了组织升高(tissue-elevated,TE)的lncRNA,并通过整合分析提炼出了稳定的TE lncRNA。我们在组织中检测到了1~4684个稳定的TE lncRNAs,其中TE lncRNA最多的是睾丸组织,其次是脑组织。TE lncRNA的功能分析表明,TE lncRNA在相应的组织相关通路中发挥重要作用。此外,我们发现,稳健的TE lncRNA的表达特征使其成为区分组织的有效生物标记物;TE lncRNA也倾向于与癌症相关,表现出差异表达或与患者生存相关。
结论:综上所述,lncRNAs的空间分类是阐明lncRNAs在维持组织形态和组织限制性疾病进展中功能的重要起点。

关键词组:空间表达;转录组;长链非编码RNA(lncRNA);癌症;生物标志物

Hypoxia-induced ROS aggravate tumor progression through HIF-1α-SERPINE1 signaling in glioblastoma

Lin ZHANG, Yuanyuan CAO, Xiaoxiao GUO, Xiaoyu WANG, Xiao HAN, Kouminin KANWORE, Xiaoliang HONG, Han ZHOU, Dianshuai GAO

DOI: 10.1631/jzus.B2200269 Downloaded: 994 Clicked: 1114 Cited: 0 Commented: 0(p.32-49) <Full Text>   <PPT>  285

Chinese summary   <86>  缺氧诱导的ROS通过HIF-1α-SERPINE1信号通路促进胶质母细胞瘤恶性进展

张琳1,2,曹媛媛2,3,郭肖肖2,4,王潇雨2,韩笑5,Kouminin KANWORE2,洪晓亮2,周晗2,高殿帅2
1徐州医科大学护理学院,中国徐州市,221004
2徐州医科大学神经生物学重点实验室,中国徐州市,221004
3泰州市中医院超声科,中国泰州市,225300
4南京医科大学康达学院基础学院,中国连云港市,222000
5南京医科大学第四临床学院,中国南京市,211166
概要:缺氧作为肿瘤微环境的重要特征,是氧化应激的主要原因,在肿瘤(包括胶质母细胞瘤)的恶性进展中发挥重要作用。缺氧微环境中高水平活性氧(ROS)促进胶质母细胞瘤进展的潜在机制尚不清楚。本研究发现缺氧促进了胶质母细胞瘤细胞增殖、迁移和侵袭以及ROS生成,而这种促进作用可被ROS清除剂N-乙酰半胱氨酸(NAC)和二苯基氯化碘盐(DPI)抑制。缺氧诱导的ROS可激活缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)信号,通过上皮-间充质转化(EMT)增强细胞迁移和侵袭。此外,在缺氧条件下,HIF-1α可与丝氨酸蛋白酶抑制剂家族E成员1(SERPINE1)启动子区结合,ROS经HIF-1α上调SERPINE1表达,进而促进胶质母细胞瘤细胞迁移和侵袭。综上所述,本研究揭示了缺氧诱导的ROS通过驱动HIF-1α-SERPINE1信号促进胶质母细胞瘤的缺氧适应,靶向ROS可能成为胶质母细胞瘤治疗的一种有效策略。

关键词组:胶质母细胞瘤;缺氧;活性氧(ROS);缺氧诱导因子-1α(HIF-1α);丝氨酸蛋白酶抑制剂家族E成员1(SERPINE1)

Targeting TRMT5 suppresses hepatocellular carcinoma progression via inhibiting the HIF-1α pathways

Qiong ZHAO, Luwen ZHANG, Qiufen HE, Hui CHANG, Zhiqiang WANG, Hongcui CAO, Ying ZHOU, Ruolang PAN, Ye CHEN

DOI: 10.1631/jzus.B2200224 Downloaded: 1004 Clicked: 1088 Cited: 0 Commented: 143(p.50-63) <Full Text>   <PPT>  276

Chinese summary   <37>  靶向TRMT5抑制HIF-1α信号通路调控肝癌进程

赵琼1,2,张璐雯1,2,何秋芬1,2,常慧1,2,王志强1,2,曹红翠3,周颖4,潘若浪5,陈烨1,2
1浙江大学医学院附属儿童医院遗传代谢科,国家儿童健康临床医学研究中心,中国杭州市,310052
2浙江省遗传缺陷与发育障碍研究重点实验室,浙江大学遗传研究所,中国杭州市,310058
3传染病诊治国家重点实验室,国家感染性疾病临床医学研究中心,浙江大学医学院附属第一医院,中国杭州市,310003
4象山县中医医院医疗健康集团,中国宁波市,315700
5浙江省细胞药物与应用技术研究重点实验室,中国杭州市,311121
概要:越来越多研究表明转运RNA(tRNA)修饰与肿瘤进程有关。本研究首次探索了线粒体tRNA G37位甲基化修饰酶TRMT5(tRNA甲基转移酶5)在肝细胞癌发生发展中的作用。生物信息学和临床分析发现TRMT5在肝癌组织中高表达且与预后不良相关。体内外实验表明TRMT5敲低可诱导肝癌细胞代谢重编程,减弱肝癌细胞的增殖和转移能力。进一步研究发现TRMT5敲低降低了肝癌细胞内缺氧诱导因子1α(HIF-1α)的稳定性,进而抑制肝癌细胞生长与转移。此外,TRMT5敲低还导致肝癌细胞对阿霉素的敏感性增加。综上所述,本研究表明靶向TRMT5可以抑制肝癌进程并提升肝癌细胞对化疗药物的敏感性。因此,TRMT5是一个新的致癌候选基因,可以作为肝癌治疗的潜在靶点。

关键词组:转运RNA(tRNA);tRNA甲基转移酶5(TRMT5);肝细胞癌;缺氧诱导因子1α(HIF-1α)

A novel defined risk signature of endoplasmic reticulum stress-related genes for predicting the prognosis and immune infiltration status of ovarian cancer

Jiahang MO, Shunyi RUAN, Baicai YANG, Yunfeng JIN, Keyi LIU, Xukai LUO, Hua JIANG

DOI: 10.1631/jzus.B2200272 Downloaded: 837 Clicked: 1035 Cited: 0 Commented: 0(p.64-77) <Full Text>   <PPT>  295

Chinese summary   <37>  基于内质网应激相关基因构建新型风险模型用于卵巢癌预后及免疫浸润状态的预测

莫佳航1,2,阮顺毅3,杨柏财4,金云峰1,2,刘可一5,罗序楷1,姜桦1,2
1复旦大学附属妇产科医院,中国上海市,200011
2复旦大学附属妇产科医院上海市女性生殖内分泌相关疾病重点实验室,中国上海市,200011
3上海交通大学医学院附属第六人民医院肿瘤科,上海交通大学医学院,中国上海市,200233
4嘉兴学院附属妇幼保健院妇产科,中国嘉兴市,314050
5浙江大学医学院附属妇科医院病理科,中国杭州市,310006
目的:开发一种基于内质网应激相关基因的预后模型,可有效预测卵巢癌(OvCa)患者的总生存期和免疫浸润状态。
方法:首先从TCGA和GEO数据库下载了552例含有RNA测序及临床信息的OvCa病例数据;并从GeneCards中提取了785个被定义为内质网应激相关的基因。然后结合单因素Cox回归分析和LASSO回归分析建立基于内质网应激基因的预后模型。在TCGA队列训练后,我们又纳入两个外部数据集进行Kaplan-Meier生存分析和时间依赖性受试者工作特征曲线(ROC)分析验证了其预后预测的性能。此外,我们还进行了GO、KEGG和GSEA功能富集分析;应用CIBERSORT算法描绘了风险分组中免疫浸润状态差异。
创新点:OvCa是一种致死率极高的妇科恶性肿瘤,具有高度的侵袭性及肿瘤异质性。大量临床研究显示OvCa对免疫治疗的应答率极低,提示瘤内免疫浸润状态不佳。因此,需要开发更为可靠的基因标志物用于预测患者的预后和免疫浸润状态。研究显示,内质网应激相关通路与卵巢癌预后密切相关,但尚缺乏基于该通路相关基因的模型用以预测患者的临床预后。本研究基于内质网应激相关基因构建了一种新型风险模型,用于患者的预后风险分层和总体生存率预测。同时,基于对肿瘤免疫浸润状态评估,该风险模型提示内质网应激的选择性激活或可改善免疫治疗在OvCa中的疗效。
结论:本研究构建了由7个内质网应激相关基因构成的预后模型,可在训练集和验证集中有效区分高风险OvCa患者,并被证明为总生存期的独立预后因子。利用诺谟图进行基于该风险特征的生存率预测。后续分析显示高低风险人群存在内质网应激通路激活的分支差异。功能富集和免疫浸润分析表明该风险特征与肿瘤免疫应答状态密切相关。综上,基于内质网应激相关基因的预后模型是一种很有前景的工具,可进行风险分层、生存预测和免疫浸润状态的评估。

关键词组:卵巢癌(OvCa);内质网应激;风险模型;预后;免疫浸润

Role of melatonin receptor 1B gene polymorphism and its effect on the regulation of glucose transport in gestational diabetes mellitus

Lijie WEI, Yi JIANG, Peng GAO, Jingyi ZHANG, Xuan ZHOU, Shenglan ZHU, Yuting CHEN, Huiting ZHANG, Yuanyuan DU, Chenyun FANG, Jiaqi LI, Xuan GAO, Mengzhou HE, Shaoshuai WANG, Ling FENG, Jun YU

DOI: 10.1631/jzus.B2200136 Downloaded: 820 Clicked: 1010 Cited: 0 Commented: 142(p.78-88) <Full Text>   <PPT>  297

Chinese summary   <31>  褪黑素受体1B基因多态性及其对葡萄糖转运的调控在妊娠期糖尿病中的作用

韦丽杰1,江一1,高鹏1,张婧怡1,周璇1,朱盛兰1,陈玉婷1,张慧婷1,都园渊1,方晨韵1,李佳琪2,高绚3,何梦舟1,王少帅1,冯玲1,余俊1
1华中科技大学同济医学院附属同济医院妇产科,中国武汉,430030
2南昌大学附属第一医院妇产科,中国南昌,330006
3亚琛工业大学医院妇产科,德国亚琛,52074
目的:探讨褪黑素受体1B基因(MTNR1B)rs10830963位点多态性与妊娠期糖尿病(GDM)发生的关联性,以及MT2受体(由MTNR1B基因编码)在滋养细胞葡萄糖摄取和转运过程中的作用及机制。
创新点:本研究探讨了中国中部地区女性人群MTNR1B基因rs10830963位点多态性与GDM发生发展之间的关系,以及MT2受体对滋养细胞中葡萄糖摄取和转运的影响。以此在一定程度上揭示MT2受体介导的褪黑素信号与GDM孕妇的新生儿高出生体重之间的关联性及可能的作用机制。
方法:本研究采用TaqMan-MGB荧光定量聚合酶链反应(qPCR)对rs10930963位点进行基因分型,分析该位点突变与GDM发生及相关代谢指标异常的关联性。采用免疫荧光、蛋白质印迹法(western blot)和qPCR检测GDM和正常孕妇胎盘中MT2受体的表达水平。体外培养滋养细胞系HTR-8/SVneo并给予褪黑素处理,利用western blot检测褪黑素信号对滋养细胞MT2受体、葡萄糖转运体(GLUTs)和激活过氧化物酶增殖物激活受体γ(PPARγ)蛋白表达水平的影响,葡萄糖检测试剂盒检测其对滋养细胞葡萄糖消耗水平的影响。进一步利用小干扰RNA(siRNA)敲低MT2受体,并采用western blot和葡萄糖检测试剂盒分别检测滋养细胞GLUTs和PPARγ的蛋白表达水平和葡萄糖消耗水平,以此探究MT2受体在褪黑素调控葡萄糖摄取和转运中的作用。
结论:MTNR1B基因的rs10830963位点多态性与GDM发生风险增加有关。MT2受体是褪黑素促进葡萄糖摄取和转运的关键受体,该过程可能由PPARγ介导。

关键词组:妊娠期糖尿病(GDM);褪黑素受体1B(MTNR1B);单核苷酸多态性(SNP);葡萄糖摄取;葡萄糖转运体(GLUTs);激活过氧化物酶增殖物激活受体γ(PPARγ)

Correspondence

Correspondence: Multidisciplinary approach for the management of term pregnancy complicated by Eisenmenger syndrome

Shibin HONG, Xin KANG, Ka U. LIO, Yiping LE, Chuan WANG, Jianhua LIN, Ning ZHANG

DOI: 10.1631/jzus.B2200368 Downloaded: 676 Clicked: 871 Cited: 0 Commented: 0(p.89-93) <Full Text>   <PPT>  240

Chinese summary   <31>  足月妊娠合并艾森曼格综合征的多学科治疗

洪士彬1,2,康昕1,Ka U.LIO3,乐怡平1,汪川1,林建华1,张宁1,2
1上海交通大学医学院附属仁济医院妇产科,中国上海市,200127
2上海交通大学医学院附属仁济医院上海市妇科肿瘤重点实验室,中国上海市,200127
3天普大学医院内科,美国宾夕法尼亚,19140
概要:妊娠合并心脏病的发病率为0.5%~3.0%,是导致孕产妇死亡的非产科病因首位。而重度肺动脉高压的处理最为棘手,合并艾森曼格综合征的孕产妇死亡率高达30%~50%,剖宫产患者甚至达65%~75%。妊娠合并重度肺动脉高压属于妊娠禁忌,一旦诊断需尽快终止妊娠,能达足月妊娠者临床非常罕见。本文报道一例足月妊娠合并重度肺动脉高压和艾森曼格综合征患者的成功诊治,旨在提高产科医师对该合并症的重视和多学科管理,并提高对该疾病围手术期的精细诊疗水平。

关键词组:足月妊娠;艾森曼格综合征;重度肺动脉高压;多学科团队(MDT)

Correspondence: Carotenoid components and their biosynthesis in a bud mutant of Shiranui mandarin (Citrus reticulata Blanco) with citrine flavedo

Xun WANG, Jinqiu HUANG, Zongyan YIN, Ke XU, Dong JIANG, Lijin LIN, Xiaoai ZHANG, Zhihui WANG

DOI: 10.1631/jzus.B2200431 Downloaded: 630 Clicked: 717 Cited: 0 Commented: 1(p.94-100) <Full Text>   <PPT>  256

Chinese summary   <33>  "不知火"黄色果皮芽变品种中类胡罗卜素组分及生物合成

王迅1,黄金秋2,尹宗艳2,许轲3,江东4,林立金1,张小艾2,汪志辉2
1四川农业大学果蔬研究所,中国成都市,611130
2四川农业大学园艺学院,中国成都市,611130
3四川省园艺作物技术推广总站,中国成都市,610041
4西南大学柑桔研究所,中国重庆市,400712
摘要:宽皮柑橘"柠檬不知火"是"不知火"的自然芽变品种,其果皮呈类似柠檬果皮的亮黄色,明显区别于"不知火"果皮的橘红色。本研究通过分析上述两种柑橘果皮中类胡罗卜素的含量和组分,及与其合成代谢相关基因的表达量,解析两种柑橘果皮颜色的差异机制。测定结果显示,"不知火"中总类胡罗卜素含量显著高于芽变品种"柠檬不知火",推测这是造成两种果皮颜色差异的主要原因。芽变品种中呈现橙色色素的组分β-隐黄质占比低于"不知火";而与绿-黄色调有关的叶黄素和新黄质这两种类胡罗卜素在芽变品种中的占比高于"不知火"。"不知火"中PSY基因的高表达可能为其类胡罗卜素合成提供了充足的底物,从而促使其果皮中较高水平的类胡罗卜素合成;HYb基因在所有基因中表达量最高,推测与其参与催化类胡罗卜素代谢途径中多个反应有关;而ZEP基因的低表达量可能与类胡罗卜素代谢途径下游产物的反馈调节有关。

关键词组:柠檬不知火;果皮色泽;高效液相色谱(HPLC);类胡罗卜素组分;基因表达

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